A toxoplasmose, causada pelo parasito Toxoplasma gondii, pode ser fatal em crianças imunocomprometidas e causar sérios danos físicos e mentais ao feto em mulheres grávidas com infecção aguda, ocorrendo em cerca de um terço da população mundial e com soroprevalência de até 85%. A detecção da doença é baseada na presença de IgM e IgG, indicando infecção aguda ou crônica, respectivamente. O diagnóstico ainda é realizado por testes imunoenzimáticos, que possuem sensibilidades e especificidades questionáveis. A tecnologia de Phage Display pode facilitar a seleção de mútliplos alvos que, clonados como quimeras recombinantes de multi-epitopos, podem aprimorar o diagnóstico e aumentar a sensibilidade e especificidade do teste, bem como funcionar como imunógenos para vacinas recombinantes. A neosporose bovina é uma doença infecciosa de origem parasitária, causada pelo protozoário Neospora caninum, parasita intracelular obrigatório, constituindo uma doença de importância econômica e expressão mundial, sendo a principal causa de abortos na pecuária de corte e leite em diversos países. Para o diagnóstico em vacas que abortaram o exame de escolha é a sorologia, que detecta os anticorpos anti-N. caninum. A vacina é baseada em taquizoítos inativados, e portanto não se tem um vacina recombinante para esta doença, que requer cultura do parasito para sua formulação. Propõe-se utilizar novas ferramentas proteômicas e phage display para a descoberta de novos alvos. O reconhecimento de antígenos destes parasitos por células imunes inatas e adaptativas ainda não é bem compeendido; não há protocolo vacinal no mercado para prevenção destas infecções; a determinação da fase de infecção por meio de testes sorológicos é incipiente.